故事的舞台是互联网系统发 达的都市「DEN C ITY」。在那里有经由巨 型企业「SOL技术社」通过 高度的网络技术构 筑而成的被称为「LINK VRAINS 」的VR空间。人们都 在那个VR空间中为体验到全 新的决斗而狂热。可是在「 LINK VRAINS」中却 出现了利用决斗来进 行黑客行为的谜 之黑客集团「海诺因 骑士团」。而他们的 目标是将存在于互联网 的某处的“AI 们的世界=电子界”毁灭。 然而在世界受到这样的 威胁时，有一名决斗 者站了出来。而他的名 字正是「Playm aker」。在那场传奇的战斗 中，「Playmak er」使用压倒性的决斗 将「海诺因骑士团」打倒，成 功捕获了「SOL 技术社」和「海诺因骑 士团」都想要得手的迷之A I程序。一度拯救了 世界，然后却突然消声匿迹了，而 他的名字就在互联网的世界中一瞬 间变得声名远播，成为了传说。而 现在，作为「Playmaker 」的正体的某位 高中生藤木游作 ，为了寻找过去发生的某件事件的 真相，对再次在 「VRAINS」出现的「海诺因 骑士团」展开了 追击...... 以此为契 机，命运的齿轮就此转动…… 迷之AI的真身，「海诺因骑士 团」盯上「Link Vrai ns」的目的，以 及隐藏在游作过去的 真相到底是———所有的答案，都 在「Link Vrain s」中！