第一部：20世纪末一个初冬夜晚，不计其数的奇异卡片突然从阴霾的天空落下，散布到世界各地。没人知道它们从何而来，作用何在。一年后，一个世界闻名的冒险家、考古学家向世界宣布，他掌握能将卡片变成巨兽的咒语，并能操纵它们战斗。随着幻兽的出现，人类社会的平衡秩序被打破。政府为了改变混乱局面，组织了两年一届的世界御兽师争霸赛。从中挑选有才能的人，以维护世界和平.故事主角之一——祺翔十分羡慕御兽师这种职业，机缘巧合得到一只幻兽momo, 之后和小伙伴玄福，希茹，以及化敌为友的朋特，开始了他们圆梦御兽师的旅程，他们经过一系列比赛的磨练，克服了种种困难，一步一步向梦想靠近，但在这时可怕的黑暗势力，正悄悄向他们伸出魔爪……第二部：这是一个全世界疯狂痴迷于卡片对战的世界。在这个世界，治理和保护环境被视为最神圣的职权。成名于世200余年的卡片世家宇文氏在第7代族长宇文锦辰的带领下，史无前例的取得了全国大赛的三连冠，使宇文氏在被长乐会压制了百余年后再次夺回了环境治理权。与此同时，宇文锦辰的三个儿子：宇文任、宇文炎、宇文士也都年满十岁，按宇文氏族例，年满十岁的子孙必须具备独立比赛的能力。双胞胎中的弟弟宇文士在十岁首演中意外失手，成为二百余年来第一个十岁首演失败的宇文氏子孙，崇尚最高卡片艺术的宇文锦辰一怒之下将宇文士逐出家门，并剥夺他的宇文姓氏。这时，我们的主人公祺翔在寻求凯德事件真相，解开环境破坏之谜的时候，意外的被卷进了这一个神奇的世界，并结识了宇文士，两人结下了深厚的友情，为了保护环境、取得认同，共同踏上了御兽卡比赛之路……！